《黑客帝国动画版》是沃卓斯基兄弟一个丝毫不逊于其电影三部曲的野心勃勃的计划：结合世界新一代顶尖动画制作人，以《黑客帝国》的故事为蓝本，独立制作出一系列和电影平行的动画短片来。这一系列各自成章，相互并没有紧密关联，但演化的都是以Matrix为主体的故事情节。
沃卓斯基兄弟以惊人的精力，花费三年时间，同美国、日本、韩国七大顶尖动画导演合作，终于完成了这一动画界和电影界的创举。目前，全系列九部动画短片已全部制作完毕，正在《黑客帝国》官方网站火热登场！
这九段动画短片集锦走的是日本原作录影带OAV路线，也就是说不在电影院上映，而只出售DVD导演沃卓期基兄弟亲自撰写“二度新生”、“少年故事”和“绝命飞行”三个剧本，“二度新生”是《黑客帝国》三部曲的前传，交代母体诞生的来龙去脉。另外，第一五部的“少年故事”和第九部“绝命飞行”则与电影《黑客任务》剧情或任务有直接的关系。
第一部：《二部新生》（Second Renaissance Part1）
剧本：沃卓斯基兄弟Andy and Larry Wachowski
导演：前田真宏Mahiro Maeda（《青之6号》）
动画设计与制作：摄氏4度工作室，东京
片长：8：23 内容简要：描述人类怎样依赖机器人的劳动，而又多么不尊重机器人，最终一个机器人奋起反抗导致其人灰主人死亡，被判处死刑。由此引发人类对机器人的歧视与仇恨。
第二部：《二部新生》（Second Renaissance Part1）
剧本：沃卓斯基兄弟Andy and Larry Wachowski
导演：前田真宏Mahiro Maeda
动画设计与制作：摄氏4度工作室，东京
片长：8：23
内容简要：机器人的反攻，Matrix形成，人类仅剩下Zion基地……
第三部：《少年故事》（Kids story）
剧本：沃卓斯基兄弟 Andy and Larry Wachowski
导演：渡边信一郎 Shinichiro Watanabe
（《星际牛仔：天国之门》）
动画设计与制作：摄氏4度工作室，东京
片长：8：55
内容简要：一个网络少年突然接到NEO（由基努·李维斯配音）的邀请（就像电影中NEO受到墨菲斯的启发一样）准备“破网而出”。然而Matrix密探们能放过他吗？
第四部：《虚拟程序》Program
剧本/导演：川尻善昭 Yoshiaki Kawajiri
（《兽兵卫忍风帖》、《吸血鬼猎人D》、《妖兽都市》）
动画设计与制作：Madhouse工作室，东京
片长：7:04
内容简要：男妇主人公在虚拟训练程序中的一段真假游戏，日式忍者风格，动作极其凌厉！
第五部：《世界纪录》World record
剧本：川尻善昭 Yoshiaki Kawajiri
导演：小池健 Takeshi Koike (《Trava》)
动画设计与制作：Madhouse工作室，东京
片长：8：29
内容简要：描述一位顶尖短跑运动员，世界纪录的保持者，如何依靠自身强大的意念和体力，突破虚拟世界的限制，最终得以见到MATRIX以外的真实世界的故事。
第六部：《超越极限》Beyond
剧本/导演：森本晃司 Koji Moimoto
（《MEMORIES》、《Beyond-city》）
动画设计与制作：摄氏4度工作室，东京
片长：12：48
内容简要：在一栋神秘的大楼里，似乎各种不可思议的事情都可发生，它窨有什么秘密？这是不是通往真实世界的出口？MATRIX密探们当然不会就此忽视，他们要极力修补这个漏洞……
第七部：《侦探的故事》Detective Story
剧本/导演：渡边信一郎 Shinichiro Watanabe
动画设计与制作：摄氏4度工作室，东京
片长：9：23
内容简要：一位名叫ASH的私人侦探，跟踪网络罪犯TRINITY（凯瑞·安妮摩斯配音），结果发现了整个世界的秘密，同时生命也受到极端威胁……
第八部：《矩阵化》Matriculated
编剧/导演：Peer Chung(编导《Aeon Flux》
系列片、参与《亚历山大战记》设计）
动画设计与制作：DNA工作室，汉城
片长：16：00
内容简要：一帮人类叛军捕获了一个机器人，利用“拟人矩阵”技术将其改造，使其不再相信“机器现实”。但改造计划大大超出了他们的预期，机器人的思想和行为已不是他们所能控制的了……
第九部：《终极战役》The Final Flight of the Osiris
剧本：沃卓斯基兄弟 Andy and Larry Wachowski
导演：安迪·琼斯 Andy Joness（《最终幻想》）
动画设计与制作：SQUARE公司
片长：11：00
内容简要：一开始是一场和《虚拟程序》中类似的训练程序，黑男和亚女分别用武士刀和中式剑来调情，眼看就要看星火燎原，不识趣的机械章鱼前来捣乱。指挥艇Osiris号飞船虽竭力逃避，但仍被逼到废弃的城市上空，在那里他们见到了简直不敢相信的情景，并且遭遇最致命的围攻，女主角被送回MATRIX进行破坏，无奈Osiris号飞船却支持不下去了……
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